Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK13Q14004 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK13Q14004 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms