Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms