Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2H2Q13888 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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