Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HTR4Q13639 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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HTR4Q13639 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HTR4Q13639 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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