Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEUROD1Q13562 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEUROD1Q13562 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms