Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IKZF1Q13422 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IKZF1Q13422 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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