Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP1Q13363 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP1Q13363 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms