Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SRSF6Q13247 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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