Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME3Q13232 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME3Q13232 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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NME3Q13232 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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NME3Q13232 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME3Q13232 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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