Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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TRAF1Q13077 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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TRAF1Q13077 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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TRAF1Q13077 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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TRAF1Q13077 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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TRAF1Q13077 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF1Q13077 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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