Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
STRN3Q13033 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
STRN3Q13033 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms