Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms