Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNIP1Q12981 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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