Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPRL3Q12980 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms