Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4Q12950 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms