Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXC1Q12948 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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