Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWF1Q12792 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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