Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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GTF3C1Q12789 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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