Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms