Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR1Q08345 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR1Q08345 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms