Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms