Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACVR1Q04771 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1Q04771 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1Q04771 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1Q04771 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACVR1Q04771 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms