Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERCC6Q03468 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms