Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREMQ03060 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREMQ03060 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREMQ03060 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREMQ03060 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREMQ03060 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREMQ03060 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREMQ03060 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREMQ03060 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREMQ03060 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREMQ03060 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREMQ03060 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREMQ03060 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms