Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms