Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCCQ00597 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCCQ00597 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms