Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5Q00535 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms