Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SKOR1P84550 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKOR1P84550 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms