Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX1P83916 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX1P83916 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX1P83916 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX1P83916 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX1P83916 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX1P83916 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX1P83916 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CBX1P83916 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CBX1P83916 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CBX1P83916 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX1P83916 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX1P83916 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX1P83916 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX1P83916 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX1P83916 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX1P83916 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX1P83916 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms