Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX3P78415 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX3P78415 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX3P78415 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms