Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF6P62330 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF6P62330 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF6P62330 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF6P62330 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARF6P62330 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms