Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2HP62256 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms