Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL3P58872 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms