Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BACE1P56817 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BACE1P56817 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BACE1P56817 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms