Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX10P56693 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX10P56693 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX10P56693 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX10P56693 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX10P56693 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX10P56693 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms