Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms