Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms