Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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PGGT1BP53609 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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