Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP2P53365 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms