Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCT3P49368 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCT3P49368 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCT3P49368 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCT3P49368 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms