Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI2P48788 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms