Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTRNP46939 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTRNP46939 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTRNP46939 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTRNP46939 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTRNP46939 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTRNP46939 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
UTRNP46939 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
UTRNP46939 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTRNP46939 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTRNP46939 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTRNP46939 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms