Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRKP46108 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRKP46108 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRKP46108 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRKP46108 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRKP46108 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms