Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP5P45974 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP5P45974 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP5P45974 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP5P45974 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms