Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ECI1P42126 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ECI1P42126 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ECI1P42126 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ECI1P42126 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ECI1P42126 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ECI1P42126 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ECI1P42126 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ECI1P42126 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ECI1P42126 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms