Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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HOXD13P35453 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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