Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF2P35240 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NF2P35240 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NF2P35240 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NF2P35240 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NF2P35240 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NF2P35240 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NF2P35240 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NF2P35240 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NF2P35240 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF2P35240 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF2P35240 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NF2P35240 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms