Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNB1P35222 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms