Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms