Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCKBRP32239 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCKBRP32239 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms